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不使用微流控如何實(shí)現(xiàn)高通量測(cè)序單細(xì)胞基因組
這篇我們要學(xué)習(xí)的是美國(guó)俄勒岡州衛(wèi)生科學(xué)大學(xué)的Andrew Adey課題組開發(fā)的新型單細(xì)胞測(cè)序技術(shù),SCI-seq,如何不需要用微流控和液滴分選就可以實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞測(cè)序?這種新型的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)
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CELL:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序探究肝癌腫瘤微環(huán)境
單細(xì)胞測(cè)序探究肝癌腫瘤微環(huán)境,在單細(xì)胞水平對(duì)肝癌腫瘤微環(huán)境中T淋巴細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組及T細(xì)胞受體(TCR)序列進(jìn)行了綜合分析,完成了超過(guò)5000個(gè)T細(xì)胞的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)?;谏镄畔W(xué)分析,該研究探索了不同亞群之間的關(guān)系,鑒定每個(gè)亞群特異的基因表達(dá),揭示了腫瘤中的T細(xì)胞在功能、分布和發(fā)展?fàn)顟B(tài)方面和其他部位的T細(xì)胞截然不同。
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(10x Genomics)詳解
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(10x Genomics)作為單細(xì)胞測(cè)序單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序領(lǐng)域的黑馬,10x Genomics這款基于微流控技術(shù)的單細(xì)胞系統(tǒng),可同時(shí)獲得1000-10000個(gè)細(xì)胞的表達(dá)信息,實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞群體的劃分與細(xì)胞群體間基因表達(dá)差異的檢測(cè),是腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性、免疫細(xì)胞群體檢測(cè)以及胚胎發(fā)育研究的黃金方法。
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鱘魚中MicroRNA轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序
鱘魚被認(rèn)為是活化石,具有很高的進(jìn)化,經(jīng)濟(jì)和保護(hù)價(jià)值。由染色體重復(fù)引起的鱘魚的倍性可能導(dǎo)致涉及倍性和生理過(guò)程的新微小RNA(miRNA)的出現(xiàn)。
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幾種石頭水果的新型從頭轉(zhuǎn)錄組裝配
ChromiumTM系統(tǒng)是一套分子條形碼和分析系統(tǒng),由儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件組成,能夠?qū)覫llumina測(cè)序儀。
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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序-毛白楊
木材形成影響木材的化學(xué)和物理性質(zhì),因此影響其作為建筑材料或生物燃料,紙漿和紙的原料的效用。
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研究人員使用RNA-Seq來(lái)構(gòu)建致命盒子果凍的觸手轉(zhuǎn)錄組
當(dāng)你到達(dá)它時(shí),盒子水母只是粘性物質(zhì)。它們的大部分體積是mesoglea,一種非生命的果凍狀物質(zhì),夾在兩個(gè)薄薄的組織層之間。它們沒有牙齒可咬,沒有爪子可以劃傷 - 當(dāng)我們想象一個(gè)無(wú)
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單細(xì)胞研究測(cè)序方法講解
單細(xì)胞研究測(cè)序方法,SCRB-seq目前是Enard中意的測(cè)序方法,它不僅適用于單細(xì)胞RNA測(cè)序,還能支持大量細(xì)胞(bulk)的RNA測(cè)序。
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